Grippe aviaire en EUROPE: Les dernières évolutions.
Des études génétiques détaillées d'échantillons de grippe aviaire H5N1 prélevés en Europe, au Moyen-Orient et en Afrique, ont révélé l'existence d'une souche euro-africaine distincte de la maladie dans la région et ont placé l'expansion de la maladie sous un nouveau jour.
Les chercheurs ont séquencé l'intégralité des génomes des 36 échantillons de H5N1 prélevés sur des oiseaux trouvés dans la région EMA (Europe, Moyen-Orient et Afrique) et au Vietnam.
La grippe aviaire a été pour la première fois détectée dans la région EMA fin 2005 et début 2006.
Les échantillons provenant de la région EMA étaient étroitement liés, bien qu'ils aient été prélevés sur des oiseaux trouvés dans des régions aussi lointaines que la Slovénie, l'Afghanistan et le Soudan. Les échantillons sont dans un lignage euro-africain distinct des trois autres lignages majeurs d'H5N1 circulant à l'heure actuelle en Asie. Cette souche EMA s'est par la suite divisée en trois sous-lignages.
«C'est la première fois que l'on examine tous les génomes de l'H5N1 en Occident», a commenté Steven Salzberg de l'Université de Maryland, auteur principal du rapport. «Jusqu'à présent, les études ont principalement été effectuées sur des exemples d'Extrême-Orient. Nos études montrent que le virus s'étend vers l'Ouest, et que trois introductions distinctes de l'H5N1 ont eu lieu en Europe, au Moyen-Orient et en Afrique.»
«Le lignage partagé des virus suggère une source génétique unique pour l'introduction de l'influenza (H5N1) en Europe de l'Ouest et en Afrique du Nord et de l'Ouest», écrivent les chercheurs, qui localisent l'origine de cette source soit en Russie, soit dans la province de Qinghai en Chine.
Par ailleurs, alors que les trois sous-lignages évoluent désormais de façon indépendante, un échantillon du virus prélevé sur un poulet nigérian s'est avéré posséder un génome résultant d'une combinaison de deux des sous-lignages de la souche EMA.
Selon les chercheurs, l'apparition des trois sous-lignages dans la même zone géographique signifie qu'il y a de grandes chances pour de telles manifestations de «réassortiment» du virus.
«Une surveillance supplémentaire sera nécessaire afin de déterminer si la souche réassortie s'étend dans la population aviaire et d'évaluer sa capacité à infecter les mammifères», ont noté les chercheurs.
«L'expansion de la souche EMA a coïncidé avec l'apparition rapide de cas sur des mammifères, ainsi que sur des humains en Turquie, en Égypte, en Irak et au Djibouti, et sur des chats en Allemagne, en Autriche et en Irak», préviennent les chercheurs, qui ajoutent que les souches EMA du virus semblent être aussi virulentes que les souches asiatiques, dont presque la moitié des cas humains se sont avérés fatals.
Selon les chercheurs, la vaste dispersion de la maladie suggère également que le mouvement humain, et non la migration des oiseaux sauvages, est principalement responsable de l'expansion rapide de l'H5N1.
«Les humains transportent des poulets à travers de nombreux pays faisant partie de notre étude, souvent sur de longues distances. Associé à des normes de biosécurité faibles dans la plupart des zones rurales, le déplacement de la volaille vivante par les humains est à l'origine de l'introduction de l'H5N1 dans certains pays.»
Source: Forum influenza H5N1 (Merci Gene). Pour suivre les derniers posts sur ce thème, en particulier l'étude des souches citées, cliquez sur ce lien.
Les chercheurs ont séquencé l'intégralité des génomes des 36 échantillons de H5N1 prélevés sur des oiseaux trouvés dans la région EMA (Europe, Moyen-Orient et Afrique) et au Vietnam.
La grippe aviaire a été pour la première fois détectée dans la région EMA fin 2005 et début 2006.
Les échantillons provenant de la région EMA étaient étroitement liés, bien qu'ils aient été prélevés sur des oiseaux trouvés dans des régions aussi lointaines que la Slovénie, l'Afghanistan et le Soudan. Les échantillons sont dans un lignage euro-africain distinct des trois autres lignages majeurs d'H5N1 circulant à l'heure actuelle en Asie. Cette souche EMA s'est par la suite divisée en trois sous-lignages.
«C'est la première fois que l'on examine tous les génomes de l'H5N1 en Occident», a commenté Steven Salzberg de l'Université de Maryland, auteur principal du rapport. «Jusqu'à présent, les études ont principalement été effectuées sur des exemples d'Extrême-Orient. Nos études montrent que le virus s'étend vers l'Ouest, et que trois introductions distinctes de l'H5N1 ont eu lieu en Europe, au Moyen-Orient et en Afrique.»
«Le lignage partagé des virus suggère une source génétique unique pour l'introduction de l'influenza (H5N1) en Europe de l'Ouest et en Afrique du Nord et de l'Ouest», écrivent les chercheurs, qui localisent l'origine de cette source soit en Russie, soit dans la province de Qinghai en Chine.
Par ailleurs, alors que les trois sous-lignages évoluent désormais de façon indépendante, un échantillon du virus prélevé sur un poulet nigérian s'est avéré posséder un génome résultant d'une combinaison de deux des sous-lignages de la souche EMA.
Selon les chercheurs, l'apparition des trois sous-lignages dans la même zone géographique signifie qu'il y a de grandes chances pour de telles manifestations de «réassortiment» du virus.
«Une surveillance supplémentaire sera nécessaire afin de déterminer si la souche réassortie s'étend dans la population aviaire et d'évaluer sa capacité à infecter les mammifères», ont noté les chercheurs.
«L'expansion de la souche EMA a coïncidé avec l'apparition rapide de cas sur des mammifères, ainsi que sur des humains en Turquie, en Égypte, en Irak et au Djibouti, et sur des chats en Allemagne, en Autriche et en Irak», préviennent les chercheurs, qui ajoutent que les souches EMA du virus semblent être aussi virulentes que les souches asiatiques, dont presque la moitié des cas humains se sont avérés fatals.
Selon les chercheurs, la vaste dispersion de la maladie suggère également que le mouvement humain, et non la migration des oiseaux sauvages, est principalement responsable de l'expansion rapide de l'H5N1.
«Les humains transportent des poulets à travers de nombreux pays faisant partie de notre étude, souvent sur de longues distances. Associé à des normes de biosécurité faibles dans la plupart des zones rurales, le déplacement de la volaille vivante par les humains est à l'origine de l'introduction de l'H5N1 dans certains pays.»
Source: Forum influenza H5N1 (Merci Gene). Pour suivre les derniers posts sur ce thème, en particulier l'étude des souches citées, cliquez sur ce lien.